Base_datos_primarios_HPVE2_TAD_docking_
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Este conjunto de datos contiene los resultados de un estudio de cribado in silico enfocado en la identificación de posibles inhibidores dirigidos al dominio de transactivación (TAD) de la proteína E2 del virus del papiloma humano tipo 16 (VPH16). El dataset incluye resultados de acoplamiento molecular, energías de unión, perfiles de interacción estructural y propiedades fisicoquímicas de compuestos seleccionados. Se evaluaron un total de 14,400 moléculas pequeñas provenientes de la biblioteca Maybridge HitFinder™, mediante simulaciones de acoplamiento molecular realizadas con el software Molecular Operating Environment (MOE). Para cada compuesto se generaron múltiples conformaciones, obteniéndose más de 63,000 confórmeros analizados. Las poses de acoplamiento fueron evaluadas mediante la función de puntuación London, y los compuestos se clasificaron en función de su afinidad de unión predicha. El conjunto de datos incluye información detallada de los compuestos con mayor afinidad de unión, incluyendo su interacción con residuos clave dentro de la cavidad de unión del dominio TAD de la proteína E2 del VPH16, tales como Tyr19, Glu39, Tyr32 y Leu99, los cuales son críticos para la interacción entre las proteínas E2 y E1, proceso esencial para la replicación del ADN viral. Adicionalmente, el dataset incorpora propiedades de "drug-likeness" basadas en las reglas de Lipinski, incluyendo peso molecular, número de donadores y aceptores de enlaces de hidrógeno, así como valores de LogP. También se incluyen datos de alineamiento de secuencia entre VPH16 y otros tipos de alto riesgo (VPH18, VPH31, VPH33 y VPH45), lo que permite evaluar la conservación estructural del sitio de unión. Este conjunto de datos tiene como objetivo apoyar investigaciones en descubrimiento de fármacos antivirales, diseño racional de fármacos basado en estructura (SBDD) y farmacología computacional, particularmente en el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas contra enfermedades asociadas al VPH.



