肌球蛋白重链10作为临床动脉粥样硬化的潜在生物标志物的新见解 数据集(2018-2022)
收藏国家青藏高原科学数据中心2023-09-20 更新2024-03-01 收录
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https://data.tpdc.ac.cn/zh-hans/data/12191fa5-2818-4557-b665-dbae88e557a4
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资源简介:
数据的收集和分析工作自2018年1月至2022年12月,通过DEGs筛选,加权基因共表达网络分析,蛋白质-蛋白质互作网络的构建和分析,功能富集分析以及GSEA分析等方法,获取动脉粥样硬化关键基因MYH10。采用Spearman和Pearson-rho检验比较内膜-中层厚度(IMT)、MYH10和-SMA表达的差异,并进行相关性分析。采用受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线分析确定MYH10和α-SMA预测AS的敏感性和特异性。采用三次样条插值算法分析MYH10和α-SMA表达与AS的高危预警范围。采用Swiss-model(https://swissmodel.expasy.org/)构建-SMA蛋白模型。使用PyMol 2.3.4软件(DeLano Scientific LLC, https://pymol.org/2/)脱水和去除受体蛋白的配体。MGL Tools软件(分子图形实验室,斯克里普斯研究所,http://mgltools.scripps.edu/)被用来氢化受体蛋白并计算电荷。采用AutoDock Vina 1.5.6(http://vina.scripps.edu/)对受体蛋白进行分子对接。采用免疫共沉淀(IP)检测MYH10与α-SMA的相互作用。
提供机构:
刘德平
创建时间:
2023-09-19



