miRStart

miRStart 2.0 provides 28,828 TSSs for 1745 human and 1181 mouse miRNAs, supported by sequencing-based signals. It integrates over 6 million tissue-specific TF-miRNA data from ChIP-seq, DNase, and conservation.miRStart 2.0 为1745个人类及1181个小鼠微小RNA（microRNA, miRNA）提供了28828个转录起始位点（Transcription Start Site, TSS），相关数据均得到测序信号的支撑。该数据集整合了逾600万份组织特异性转录因子-微小RNA（Transcription Factor-microRNA, TF-miRNA）数据，来源涵盖染色质免疫沉淀测序（Chromatin Immunoprecipitation sequencing, ChIP-seq）、脱氧核糖核酸酶I超敏感位点测序（DNase-seq）以及进化保守性分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

miRStart 2.0是一个专注于miRNA上游调控的数据库，它注释了人类和小鼠共28,828个转录起始位点（TSS），涵盖1,745个人类和1,181个小鼠miRNA。该数据库整合了基于测序的信号数据，并提供两种查询模式：通过miRNA查找相关转录因子（TF），或通过TF查找调控的miRNA，以支持组织特异性调控网络分析。