genbio-ai/ProteinGYM-DMS-RAG-zeroshot

Name: genbio-ai/ProteinGYM-DMS-RAG-zeroshot
Creator: genbio-ai
Published: 2025-05-12 18:45:49
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Hugging Face2025-05-12 更新2025-05-31 收录

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genbio-ai/ProteinGYM-DMS-RAG

ProteinGYM DMS Benchmark是一个针对AIDO.RAG的基准数据集，包含单个替换类型的突变数据。每个数据文件代表一个特定蛋白序列上所有可能的突变，并采用随机交叉验证方案分为五份。标签为0到1之间的连续值，任务分为不同的功能组别。

Hugging Face2025-07-07 更新230

genbio-ai/fluorescence_prediction_rag

荧光预测数据集专注于预测绿色荧光蛋白突变体的荧光强度，这对于生物学研究非常重要，可以帮助研究人员推断细胞系和活体生物中蛋白质的存在。这个回归任务使用训练和评估数据集，其中包含三个或更少突变的突变体，与测试数据集形成对比，后者包含四个或更多突变的突变体。每个实例包括一个表示蛋白质序列的字符串和一个表示蛋白质序列荧光分数的浮点值。数据集分为训练集、验证集和测试集三个部分，分别包含21446、5362和

Hugging Face2025-04-09 更新110

genbio-ai/contact_prediction_binary_rag

这是一个蛋白质接触图预测数据集，用于预测蛋白质序列中两个残基是否在小于8埃的阈值内接触。数据集包括蛋白质序列和对应的接触标签，分为训练集、验证集和测试集。数据来源于trRosetta数据集，并采用Apache-2.0许可证发布。

Hugging Face2025-04-09 更新160

genbio-ai/ProteinGYM-DMS

# ProteinGYM DMS Benchmark DMS Benchmark includes three types of mutations: indels, single substitution and multiple substitutions. Each tsv file contains all data for a single task, representing al

Hugging Face2024-12-07 更新70

genbio-ai/fold_prediction_rag

Fold Prediction Dataset for RAGProtein数据集是一个用于蛋白质折叠类预测的任务的数据集，它将蛋白质序列分配到已知的1195个折叠中的一个。该数据集主要用于识别蛋白质中的新型远亲同源基因，如抗生素耐药基因和工业酶。数据集包括蛋白质序列字符串和指示蛋白质序列所属已知折叠的整数标签。数据集分为训练集、验证集和测试集，基于SCOP 1.75数据库构建。

Hugging Face2025-04-09 更新30