213个微生物菌株获得的571个质谱数据集

该MALDI-TOF数据集包括： A） 一个由20种革兰氏阳性和阴性细菌组成的参考小组，涵盖9个属，其中有几种已知难以通过质谱（MALDI-TOF）进行区分。每个物种由7到20个细菌菌株获得的11到60个质谱表示，构成了213个菌株获得的571个质谱数据集。根据临床常规中使用的基于标准培养的工作流程获得光谱，其中微生物首先在琼脂平板上培养24至48小时，然后提取部分菌落，在MALDI玻片上进行斑点，并获得质谱。 B） 基于该参考面板，构建了专用的体外模拟混合物数据集。为此，我们考虑了10对不同分类接近度的物种： *4种混合物，标记为A、B、C和D，涉及属于同一属的物种， *2种混合物，标记为E和F，涉及属于不同属但属于相同革兰氏类型的物种， *4种混合物，标记为G、H、I和J，涉及属于不同革兰氏类型的物种。 每个混合物由2对菌株表示，它们按照以下9个浓度比进行混合：1:0、10:1、5:1、2:1、1:1、1:2、1:5、1:10、0:1。 针对每个浓度比和每对菌株获得了两个重复光谱，总共形成了360个光谱数据集，其中80个光谱实际上是纯样品光谱。 Attribute Information: Provide information about each attribute in your data set. Relevant Papers: Mahé et al. (2014). Automatic identification of mixed bacterial species fingerprints in a MALDI-TOF mass-spectrum. Bioinformatics. Vervier et al., A benchmark of support vector machines strategies for microbial identification by mass-spectrometry data, submitted Citation Request: If you have no special citation requests, please leave this field blank. Pierre Mahé, pierre.mahe '@' biomerieux.com, bioMérieux Jean-Baptiste Veyrieras, jean-baptiste.veyrieras '@' biomerieux.com, bioMérieux