MDSi
收藏国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介：
MDSi contains xiaomi genome of 161,844 annotations, 34,436 protein-coding genes and their expression information in 29 different tissues of xiaomi (6) and JG21 (23) samples that can be showed as an Electronic Fluorescent Pictograph (xEFP) in-situ. Moreover, the whole-genome resequencing (WGS) data of 398 germplasms, including 360 foxtail millets and 38 green foxtails and the corresponding metabolic data were available in MDSi.
MDSi 数据库收录了包含161,844条注释信息、34,436个蛋白编码基因的小米基因组，以及取自6份小米样本与23份JG21样本的29种不同组织的基因表达数据；此类表达信息可通过电子荧光原位图谱（Electronic Fluorescent Pictograph, xEFP）进行可视化展示。此外，MDSi 还提供了398份种质资源的全基因组重测序（Whole-Genome Resequencing, WGS）数据，其中涵盖360份谷子与38份狗尾草，同时配套发布了相应的代谢组学数据。
提供机构：
Shanxi Agricultural University
创建时间：
2023-08-28
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
MDSi数据集包含小米基因组的161,844个注释和34,436个蛋白质编码基因，以及这些基因在29种不同组织中的表达信息。此外，该数据集还提供了398种种质资源（包括360个谷子和38个青狗尾草）的全基因组重测序数据及相应代谢数据。
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