Additional file 4 of COPLA, a taxonomic classifier of plasmids

Additional file 4. Benchmark for 1000 new plasmids of RefSeq200 dataset. Predicted PTU, host range and prediction score of COPLA for randomly chosen 1000 plasmids not present in the current COPLA reference database.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是COPLA（质粒分类分类器）的附加文件4，发布于2021年，提供了对RefSeq200数据集中1000个新质粒的基准测试结果，包括预测的PTU、宿主范围和COPLA的预测分数。这些质粒未包含在当前的COPLA参考数据库中，旨在支持质粒分类和抗生素耐药性基因研究，涉及水平基因转移、质粒流行病学等主题，属于跨学科生物科学领域。