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失语症恢复队列（ARC）是一个大规模、纵向的多模态神经影像数据集，包含230名慢性中风失语症患者的多模态MRI扫描数据。该数据集提供了BIDS格式的数据，包括T1加权、T2加权、FLAIR结构扫描、BOLD fMRI（命名任务和静息状态）、扩散加权成像（DWI）等。数据集还包含专家绘制的病变掩码和临床元数据，如年龄、性别、种族、WAB-AQ评分等。该数据集支持多种任务，如病变分割、失语症严重程度预测、失语症类型分类等。数据集已去标识化和去面部化，符合HIPAA指南。
Aphasia Recovery Cohort (ARC) is a large-scale, longitudinal multi-modal neuroimaging dataset comprising multi-modal MRI scans from 230 patients with chronic stroke-induced aphasia. The dataset is provided in BIDS format, including T1-weighted, T2-weighted, FLAIR structural scans, BOLD fMRI (including naming task and resting-state), diffusion-weighted imaging (DWI), and other modalities. It also contains expert-drawn lesion masks and clinical metadata such as age, gender, race, WAB-AQ scores, and more. This dataset supports multiple downstream tasks including lesion segmentation, aphasia severity prediction, and aphasia subtype classification. The dataset has been de-identified and defaced, and complies with HIPAA guidelines.
Aphasia Recovery Cohort (ARC) 数据集概述
数据集基本信息
- 数据集名称：Aphasia Recovery Cohort (ARC)
- 主要用途：用于卒中后失语症研究的多模态神经影像数据集。
- 数据格式：BIDS格式，包含嵌入式NIfTI文件。
- 许可协议：CC0 1.0（公共领域）。
- 语言：英语（临床元数据和文档）。
数据规模与内容
- 受试者：230名慢性卒中失语症患者。
- 扫描会话：902次。
- 影像模态与数量：
- T1加权扫描：441个会话（每个会话恰好一次扫描）。
- T2加权扫描：439个会话（每个会话恰好一次扫描）。
- FLAIR扫描：231个会话（每个会话恰好一次扫描）。
- BOLD fMRI（命名任务）：750个会话（894次运行）。
- BOLD fMRI（静息态）：498个会话（508次运行）。
- 弥散成像（DWI）：613个会话（2，089次运行）。
- 单波段参考图像：88个会话（322次运行）。
- 专家绘制的病灶掩膜：228个。
支持的任务
- 病灶分割
- 失语症严重程度预测（回归任务）
- 失语症类型分类
- 纵向分析
- 弥散分析
- 任务态fMRI分析
数据集结构
数据实例
每个数据行代表一个扫描会话（受试者+时间点），包含以下字段：
subject_id：受试者标识符。session_id：会话标识符。- 结构影像：
t1w，t2w，flair（可为空）。 - 功能影像：
bold_naming40，bold_rest。 - 弥散影像：
dwi，dwi_bvals，dwi_bvecs。 - 参考影像：
sbref。 - 病灶标注：
lesion（可为空）。 - 临床元数据：
age_at_stroke，sex，race，wab_aq，wab_days，wab_type。
数据划分
- 训练集：包含全部902个会话。未预设训练/验证/测试划分，使用者需自行划分，并确保不同划分间无受试者重叠。
数据来源与标注
- 原始来源：数据收集于南卡罗来纳大学和南卡罗来纳医科大学。
- 公开来源：OpenNeuro ds004884 (https://openneuro.org/datasets/ds004884)。
- 相关论文：Gibson et al., Scientific Data 2024 (https://doi.org/10.1038/s41597-024-03819-7)。
- 标注：病灶掩膜由神经影像专家在T1加权或FLAIR图像上手动勾画。
隐私与伦理考虑
- 数据已根据HIPAA指南进行去标识化处理。
- 结构MRI图像已进行去面部处理。
- 不包含受保护的健康信息。
- 所有参与者均同意公开数据共享。
使用注意事项
已知偏差
- 地理偏差：数据主要来自美国东南部的医疗中心。
- 年龄偏差：卒中主要影响老年人，儿科病例代表性不足。
- 严重程度偏差：由于知情同意要求，极严重失语症病例可能代表性不足。
已知局限性
- 并非所有会话都包含全部模态数据。
- 228/230名受试者有病灶掩膜。
- 受试者的纵向随访次数不同（1-12次会话）。
技术说明
- 多运行模态以列表形式提供，空列表表示该会话无此数据。
- 弥散成像数据包含对齐的梯度信息（
dwi_bvals，dwi_bvecs）。 - NIfTI文件按需加载，适合大规模流式处理。
版本更新
- v2 (2025年12月)：将
bold列拆分为bold_naming40和bold_rest；新增dwi_bvals，dwi_bvecs，race，wab_days，t2w_acquisition列。 - v1 (2025年12月)：初始发布，包含13个列。
引用信息
如需引用，请使用README中提供的BibTeX条目。
