SILVA

SILVA is a comprehensive, quality-controlled web resource for up-to-date aligned ribosomal RNA (rRNA) gene sequences from the Bacteria, Archaea and Eukaryota domains alongside supplementary online services. In addition to data products, SILVA provides various online tools such as alignment and classification, phylogenetic tree calculation and viewer, probe/primer matching, and an amplicon analysis pipeline. With every full release a curated guide tree is provided that contains the latest taxonomy and nomenclature based on multiple references. SILVA is an ELIXIR Core Data Resource.SILVA是一款全面且经严格质量管控的网络资源，可为用户提供细菌域、古菌域与真核生物域的最新比对版核糖体RNA（ribosomal RNA, rRNA）基因序列，并配套各类补充在线服务。除核心数据产品外，SILVA还提供多种在线分析工具，涵盖序列比对与分类、系统发育树计算与查看、探针/引物匹配，以及扩增子分析流程。每一次正式发布版本中，SILVA均会附带一棵经精心校勘的参考指导树，该树基于多套参考序列构建，包含最新的分类学体系与命名规范。SILVA属于ELIXIR核心数据资源。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SILVA是一个全面的在线资源，提供经过质量检查和对齐的核糖体RNA序列数据，涵盖所有三个生命域（细菌、古菌和真核生物）。它包含小亚基和大亚基rRNA序列，并集成了比对、分类和系统发育分析等在线工具，是ELIXIR核心数据资源。