SpatialRef

SpatialRef is a manually curated reference database aggregating >9 million spatially annotated spots across human, mouse, and Drosophila tissues. It provides high-quality, technology-agnostic spatial domain labels enabling downstream analyses like spatial gene expression, communication, trajectory inference, and functional enrichment (GO/KEGG) to elucidate tissue organization and function.SpatialRef是一款经人工整理标注的参考数据库，整合了覆盖人类、小鼠及果蝇组织的逾900万个空间注释位点。该库提供高质量、技术无关的空间区域标签，可支持空间基因表达、细胞通讯、轨迹推断及功能富集（GO/KEGG）等下游分析，以阐明组织的结构与功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SpatialRef是一个手动整理的空间组学参考数据库，聚合了超过900万个空间注释点，覆盖人类、小鼠和果蝇的17种组织类型，细分为432种点类型或空间域。它基于多种技术平台的数据，并利用原始论文注释确保准确性，提供基因表达、通路富集和空间轨迹等分析功能，以帮助阐明组织结构和功能。