MicrobiomeNet

MicrobiomeNet integrates vast data on microbial associations (5.8 million entries) with genome-scale metabolic models (GEMs) for over 6000 species to provide mechanistic insights into how microbes interact via their metabolic activities. It allows users to explore these associations and compare the underlying metabolic profiles of the involved microbes. The database aims to link microbial interaction patterns with their metabolic potential for translational applications.

微生物组网络数据库（MicrobiomeNet）整合了含580万条记录的海量微生物关联数据，以及覆盖6000余个物种的基因组规模代谢模型（Genome-scale Metabolic Models, GEMs），可为解析微生物通过代谢活动相互作用的机制提供深入洞见。该平台支持用户探索此类微生物关联，并对比所涉微生物的基础代谢谱。本数据库旨在搭建微生物相互作用模式与其代谢潜力之间的关联，以推动转化应用研究。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MicrobiomeNet是一个综合性微生物组数据库，整合了约600万微生物统计关联数据和12,400个基因组规模代谢模型（GEMs），用于研究微生物间的关联和代谢相互作用。该数据库覆盖广泛的微生物分类群，并提供137条代谢途径的详细信息，支持用户进行微生物关联网络和代谢兼容性分析。