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Greenish Warbler consensus genome v1.0

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DataONE2016-08-01 更新2024-06-26 收录
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资源简介:
Contains a consensus greenish warbler genome assembly, based on a consensus of genome assemblies of three greenish warbler (Phylloscopus trochiloides) individuals (viridanus TL2; trochiloides LN10; and plumbeitarsus BK2). The file contains sequences for 31 chromosomes and chromosome fragments, based on mapping of greenish warbler contigs to the zebra finch genome assembly (version 3.2.4; Warren et al. 2010). The file is in standard Fasta format. It needs to be un-compressed first by running the command: gunzip Phylloscopus_trochiloides.Greenish_warbler.3sample.consensus.wrapped.toplevel.fa.gz The three whole-genome shotgun assemblies have been deposited at DDBJ/ENA/GenBank under the accessions LXPA00000000 (viridanus), LXOZ00000000 (trochiloides), and LXOY00000000 (plumbeitarsus).
创建时间:
2016-08-01
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