five

Data from: DNA methylation as a possible mechanism affecting ability of natural populations to adapt to changing climate

收藏
DataONE2018-08-14 更新2024-06-08 收录
下载链接:
https://search.dataone.org/view/null
下载链接
链接失效反馈
资源简介:
Environmentally induced epigenetic variation has been recently recognized as a possible mechanism allowing plants to rapidly adapt to novel conditions. Despite increasing evidence on the topic, little is known on how epigenetic variation affects responses of natural populations to changing climate. We studied the effects of experimental demethylation (DNA methylation is an important mediator of heritable control of gene expression) on performance of a clonal grass, Festuca rubra, coming from localities with contrasting temperature and moisture regimes. We compared performance of demethylated and control plants from different populations under two contrasting climatic scenarios and explored whether the response to demethylation depended on genetic relatedness of the plants. Demethylation significantly affected plant performance. Its effects interacted with population of origin and partly with conditions of cultivation. The effects of demethylation also varied between distinct genotypes with more closely related genotypes showing more similar response to demethylation. For belowground biomass, demethylated plants showed signs of adaptation to drought that were not apparent in plants that were naturally methylated. The results suggest that DNA methylation may modify the response of this species to moisture. DNA methylation may thus affect the ability of clonal plants to adapt to novel climatic conditions. Whether this variation in DNA methylation may also occur under natural conditions, however, remains to be explored. Despite the significant interactions between population of origin and demethylation, our data do not provide clear evidence that DNA methylation enabled adaptation to different environments. In fact, we obtained stronger evidence of local adaptation in demethylated than in naturally-methylated plants. As changes in DNA methylation may be quite dynamic, it is thus possible that epigenetic variation can mask plant adaptations to conditions of their origin due to pre-cultivation of the plants under standardized conditions. This possibility should be considered in future experiments exploring plant adaptations.
创建时间:
2018-08-14
用户留言
有没有相关的论文或文献参考?
这个数据集是基于什么背景创建的?
数据集的作者是谁?
能帮我联系到这个数据集的作者吗?
这个数据集如何下载?
点击留言
数据主题
具身智能
数据集  4099个
机构  8个
大模型
数据集  439个
机构  10个
无人机
数据集  37个
机构  6个
指令微调
数据集  36个
机构  6个
蛋白质结构
数据集  50个
机构  8个
空间智能
数据集  21个
机构  5个
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
热门数据集

ICLR Peer Review and Rebuttal Process Dataset

该数据集包含从ICLR 2024和2025年收集的同行评审和反驳过程数据,数据来自OpenReview平台,包括评审者ID、初始评分和反驳后评分。评审者评分变化被追踪,使用追踪分数指标来评估评审者连续性,分数≤1表示有效使用,≥2需双重检查。数据许可证为CC BY 4.0。

github 收录

中国区域地面气象要素驱动数据集 v2.0(1951-2024)

中国区域地面气象要素驱动数据集(China Meteorological Forcing Data,以下简称 CMFD)是为支撑中国区域陆面、水文、生态等领域研究而研发的一套高精度、高分辨率、长时间序列数据产品。本页面发布的 CMFD 2.0 包含了近地面气温、气压、比湿、全风速、向下短波辐射通量、向下长波辐射通量、降水率等气象要素,时间分辨率为 3 小时,水平空间分辨率为 0.1°,时间长度为 74 年(1951~2024 年),覆盖了 70°E~140°E,15°N~55°N 空间范围内的陆地区域。CMFD 2.0 融合了欧洲中期天气预报中心 ERA5 再分析数据与气象台站观测数据,并在辐射、降水数据产品中集成了采用人工智能技术制作的 ISCCP-ITP-CNN 和 TPHiPr 数据产品,其数据精度较 CMFD 的上一代产品有显著提升。 CMFD 历经十余年的发展,其间发布了多个重要版本。2019 年发布的 CMFD 1.6 是完全采用传统数据融合技术制作的最后一个 CMFD 版本,而本次发布的 CMFD 2.0 则是 CMFD 转向人工智能技术制作的首个版本。此版本与 1.6 版具有相同的时空分辨率和基础变量集,但在其它诸多方面存在大幅改进。除集成了采用人工智能技术制作的辐射和降水数据外,在制作 CMFD 2.0 的过程中,研发团队尽可能采用单一来源的再分析数据作为输入并引入气象台站迁址信息,显著缓解了 CMFD 1.6 中因多源数据拼接和气象台站迁址而产生的虚假气候突变。同时,CMFD 2.0 数据的时间长度从 CMFD 1.6 的 40 年大幅扩展到了 74 年,并将继续向后延伸。CMFD 2.0 的网格空间范围虽然与 CMFD 1.6 相同,但其有效数据扩展到了中国之外,能够更好地支持跨境区域研究。为方便用户使用,CMFD 2.0 还在基础变量集之外提供了若干衍生变量,包括近地面相对湿度、雨雪分离降水产品等。此外,CMFD 2.0 摒弃了 CMFD 1.6 中通过 scale_factor 和 add_offset 参数将实型数据化为整型数据的压缩技术,转而直接将实型数据压缩存储于 NetCDF4 格式文件中,从而消除了用户使用数据时进行解压换算的困扰。 本数据集原定版本号为 1.7,但鉴于本数据集从输入数据到研制技术都较上一代数据产品有了大幅的改变,故将其版本号重新定义为 2.0。

国家青藏高原科学数据中心 收录

COCA (Corpus of Contemporary American English)

COCA是一个包含超过5.2亿词的英语语料库,涵盖了从1990年至今的文本。它包括口语、小说、流行杂志、报纸和学术文章五种文体,旨在反映当代美国英语的使用情况。

www.english-corpora.org 收录

BDD100K

数据集推动了视觉的进步,但现有的驾驶数据集在视觉内容和支持任务方面缺乏研究,以研究自动驾驶的多任务学习。研究人员通常只能在一个数据集上研究一小组问题,而现实世界的计算机视觉应用程序需要执行各种复杂的任务。我们构建了最大的驾驶视频数据集 BDD100K,包含 10 万个视频和 10 个任务,以评估图像识别算法在自动驾驶方面的令人兴奋的进展。该数据集具有地理、环境和天气的多样性,这对于训练不太可能对新条件感到惊讶的模型很有用。基于这个多样化的数据集,我们为异构多任务学习建立了一个基准,并研究了如何一起解决这些任务。我们的实验表明,现有模型需要特殊的训练策略来执行此类异构任务。 BDD100K 为未来在这个重要场所的学习打开了大门。更多详细信息请参见数据集主页。

OpenDataLab 收录

OpenML-CC18

我们提倡使用经过整理的、全面的机器学习数据集基准测试套件,以标准化的基于 OpenML 的接口和用 Python、Java 和 R 编写的互补软件工具包为后盾。我们展示了如何使用标准化的基于 OpenML 的基准测试套件轻松执行全面的基准测试研究以及用 Python、Java 和 R 编写的互补软件工具包。 OpenML 基准测试套件的主要显着特点是 (i) 通过标准化数据格式、API 和现有客户端库易于使用; (ii) 关于套件内容的机器可读元信息; (iii) 在线共享结果,实现大规模比较。作为第一个这样的套件,我们提出了 OpenML-CC18,这是一个机器学习基准套件,包含 72 个分类数据集,从 OpenML 上的数千个数据集中精心策划。纳入标准是: * 密集数据集独立观察的分类任务 * 类数 >= 2,每个类至少有 20 个观察和少数类与多数类的比例必须超过 5% * 500 <= 观察数 <= 100000 * one-hot-encoding 后的特征数量 < 5000 * 没有人工数据集 * 没有更大数据集的子集,也没有其他数据集的二值化 * 没有可以通过使用单个特征或使用简单的决策树来完全预测的数据集* 来源或参考可用 如果您使用此基准测试套件,请引用:Bernd Bischl、Giuseppe Casalicchio、Matthias Feurer、Frank Hutter、Michel Lang、Rafael G. Mantovani、Jan N. van Rijn 和 Joaquin Vanschoren。 “OpenML 基准测试套件”arXiv:1708.03731v2 [stats.ML] (2019)。 @article{oml-benchmarking-suites, title={OpenML Benchmarking Suites}, author={Bernd Bischl and Giuseppe Casalicchio and Matthias Feurer and Frank Hutter and Michel Lang and Rafael G. Mantovani and Jan N. van Rijn and Joaquin Vanschoren},年={2019},日记={arXiv:1708.03731v2 [stat.ML]} }

OpenDataLab 收录