HMicroDB

HMicroDB is the first herpetofaunal microbiota database that integrates 11,697 microbiological samples from 337 host species (covering 23 body sites and associated with 23 host phenotypic or environmental factors), and we identified 11,084 microbial taxa by consistent annotation. The standardised analysis process, cross-dataset integration, user-friendly interface, and interactive visualisation make the HMicroDB a powerful resource for researchers to search, browse, and explore the relationships between symbiotic microbiota, hosts, and environment.HMicroDB是首个两栖爬行动物微生物群数据库（herpetofaunal microbiota database），整合了来自337个宿主物种的11697份微生物样本，覆盖23个身体部位且关联23种宿主表型或环境因素；研究团队通过统一注释共鉴定出11084个微生物类群。标准化的分析流程、跨数据集整合、用户友好的界面以及交互式可视化功能，使HMicroDB成为一款功能强大的科研资源，可助力研究者检索、浏览并探索共生微生物群、宿主与环境三者间的关联关系。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

HMicroDB是一个综合性的两栖动物和爬行动物共生微生物群数据库，整合了来自337个宿主物种的11,697个样本，覆盖23个身体部位并关联23个宿主表型或环境因素，识别了11,084个微生物类群。该数据库提供标准化分析、跨数据集集成、用户友好界面和交互式可视化工具，便于研究人员探索微生物群与宿主及环境的关系。