scATAC-Ref

We designed scATAC-Ref, a manually curated scATAC-seq database aimed at providing a comprehensive, high-quality source of chromatin accessibility profiles with known cell labels across broad cell types. Currently, scATAC-Ref comprises 1 694 372 cells with known cell labels, across various biological conditions, >400 cell/tissue types and five species.

我们构建了scATAC-Ref，这是一款经人工整理注释的单细胞转座酶可及性测序（scATAC-seq）数据库，旨在提供覆盖多样细胞类型、带有已知细胞标签的全面且高质量的染色质可及性谱资源。目前，scATAC-Ref共收录1 694 372个带有已知细胞标签的细胞，覆盖多种生物学状态、超过400种细胞/组织类型以及5个物种。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scATAC-Ref是一个多物种单细胞ATAC-seq参考数据库，涵盖5个物种的400多种细胞类型和近170万细胞，提供统一计算的染色质可及性分析结果和用户友好的交互界面。该数据库旨在帮助研究细胞异质性和发现关键细胞亚型及潜在标记物。