解析PFC脑区的空间单细胞转录组-连接图谱数据集

发育神经科学的一个基本兴趣在于能够绘制大脑内的完整单细胞谱系。为此，我们开发了一种基于CRISPR编辑的谱系特异性示踪（CREST）方法，用于在Cre小鼠中进行克隆追踪。然后，我们使用基于CREST的两种互补策略来绘制发展中小鼠腹侧中脑（vMB）的单细胞谱系。通过应用snapshotting CREST（snapCREST），我们构建了发展中vMB的时空谱系，并确定了六个可能代表个体vMB前体主要克隆命运的原型前体，以及指定谷氨酸能、多巴胺能或两者神经元的前庭板内的三个不同克隆谱系。此外，我们还创建了pandaCREST（前体和衍生物关联CREST）来将体内前体细胞的转录组与其分化潜能关联起来。我们确定了多个多巴胺能神经元的起源，并证明了以转录组定义的前体类型包括异质的前体，每个前体都具有不同的克隆命运和分子特征。因此，CREST方法和策略允许进行全面的单细胞谱系分析，可以为理解神经特异性背后的分子程序提供新的见解。