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中山医院肝癌患者蛋白质组数据|肝癌分子分型数据集|蛋白质组学数据集

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国家人口健康科学数据中心2024-03-04 收录
肝癌分子分型
蛋白质组学
下载链接:
https://www.ncmi.cn/phda/dataDetails.html?type=project_data&id=CSTR:A0006.11.A0014.202009.210.V1.0
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资源简介:
项目组采用蛋白质谱技术得到了126对肝癌/癌旁组织的蛋白质表达谱的蛋白质组数据(图8.1)。通过对样本临床信息及表达谱数据蛋白鉴定量及质控数据的进一步审核。选择了有HBV感染的早期肝癌(BCLC0-A),质控过关的111例样本的数据用于后续的分析。利用磷酸化肽段富集我们已经完成了116对HBV阳性肝癌病人的癌及癌旁样本的磷酸化蛋白质组分析。共检测定量到 6,301 磷酸化蛋白及36,552磷酸化位点(其中高可信度位点28,228个)。通过非负矩阵分解(NMF)的一致性聚类分析(consensus clustering)方法,将早期肝癌患者显著划分为3个亚型
提供机构:
复旦大学
创建时间:
2021-12-10
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