SILVA Release 138

The SILVA database project provides comprehensive, quality checked and regularly updated databases of aligned small (16S / 18S, SSU) and large subunit (23S / 28S, LSU) ribosomal RNA (rRNA) sequences for all three domains of life (Bacteria, Archaea and Eukarya).

SILVA数据库项目提供了涵盖生命三域（细菌、古菌和真核生物）中所有物种的全面、经过质量验证且定期更新的对齐小亚基（16S/18S、SSU）和大亚基（23S/28S、LSU）核糖体RNA（rRNA）序列数据库。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SILVA Release 138是一个核糖体RNA基因数据库，发布于2019年12月16日，包含小亚基（SSU）和大亚基（LSU）rRNA序列，其中SSU Ref有2,225,272条序列，SSU Ref NR 99有510,984条序列，覆盖细菌、古菌和真核生物。该版本的特点包括进行了重大分类学更新，采用了GTDB等资源，并改进了聚类工具以增强稳定性。