Gemma

Database of curated, reanalyzed gene expression datasets for differential expression, coexpression and meta-analysis. Contains over 8000 data sets (>400,000 samples), primarily from GEO. Most experiments are re-analyzed from raw data and batch-corrected.

本数据库收录经人工精选并重分析的基因表达数据集，可用于差异表达分析、共表达分析及荟萃分析。数据库包含逾8000个数据集（超400000份样本），数据主要源自基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）。绝大多数实验数据均从原始数据出发完成重分析，并进行了批次校正。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Gemma是一个经过整理和重新分析的基因表达研究数据库，包含数千个微阵列和RNA-seq实验，提供数据、实验设计注释和差异表达分析结果。它覆盖多种物种，尤其关注神经系统相关研究，并支持单细胞数据分析，样本总数超过69万。