ScInfeRDB
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ScInfeRDB is an interactive database that provides curated scRNA-seq references and marker sets for 329 cell types across 28 tissue types. It supports accurate cell-type annotation in scRNA-seq, scATAC-seq, and spatial transcriptomics datasets, demonstrating superior performance and robustness against batch effects. ScInfeRDB is publicly available to facilitate seamless cell-type classification.
ScInfeRDB是一款交互式数据库，提供经精心筛选整理的、覆盖28种组织类型的329种细胞类型的单细胞RNA测序（scRNA-seq）参考数据集与标记基因集。该数据库可实现对单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及性测序（scATAC-seq）及空间转录组学数据集的精准细胞类型注释，且在抵御批次效应方面展现出优异的性能与鲁棒性。ScInfeRDB现已公开可用，旨在助力实现便捷流畅的细胞类型分类工作。
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印度理工学院搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
ScInfeRDB是一个交互式数据库，为28种组织类型中的329种细胞类型提供经过筛选的单细胞RNA测序参考数据和标记集。该数据库支持在单细胞RNA测序、ATAC测序及空间转录组学数据中进行准确的细胞类型注释，具有高性能和抗批次效应的特点，并公开可用以促进无缝的细胞类型分类。
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