PPI3D

PPI3D offers three interaction exploration modes: (i) all interactions for proteins homologous to the query, (ii) interactions between two proteins or their homologs and (iii) interactions within a specific PDB entry.三维蛋白质-蛋白质相互作用数据集（PPI3D）提供三种交互探索模式：(i) 与查询蛋白同源的蛋白质的全部相互作用；(ii) 两种蛋白质或其同源蛋白之间的相互作用；(iii) 特定PDB（蛋白质数据银行，Protein Data Bank）条目内的相互作用。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PPI3D是一个基于网络的服务平台，用于在三维结构背景下搜索、分析和建模蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽及蛋白质-核酸相互作用。它支持单序列搜索、双序列搜索和PDB条目查询，并提供详细的相互作用界面信息与结构建模功能。