EXPANSION

EXPANSION is a new pipeline and webserver to explore the functional consequences of an input list of protein-coding alternative splice variants, for example, differentially expressed (DE) instances from transcriptomics datasets. We combined information of DE protein-coding transcripts from cancer genomics with information of domain architecture, protein interaction network and gene enrichment analysis.EXPANSION是一款全新的分析流程与在线服务器，可用于探究一组输入的编码蛋白质的可变剪接变体的功能效应，例如转录组学数据集来源的差异表达（differentially expressed，DE）可变剪接实例。本研究将癌症基因组学中获取的差异表达编码蛋白转录本信息，与蛋白质结构域架构、蛋白质相互作用网络以及基因富集分析的相关信息进行了整合。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

EXPANSION是一个用于探索蛋白质编码选择性剪接变异功能性后果的流程和网络服务器，特别适用于分析来自转录组学数据集的差异表达实例。它整合了癌症基因组学中的差异表达蛋白质编码转录本信息，并结合了结构域架构、蛋白质相互作用网络和基因富集分析，以提供全面的功能分析。