多个数据集

这是一个收集了多个领域高质量公共数据源的仓库，包括农业、生物学等多个领域的数据集。

This repository aggregates high-quality public data sources across multiple domains, including agriculture, biology, and more.

原始信息汇总

数据集概述

农业

• U.S. Department of Agricultures Nutrient Database

  • 链接: U.S. Department of Agricultures Nutrient Database

• U.S. Department of Agricultures PLANTS Database

  • 链接: U.S. Department of Agricultures PLANTS Database

生物学

• 1000 Genomes

  • 链接: 1000 Genomes

• American Gut (Microbiome Project)

  • 链接: American Gut (Microbiome Project)

• Broad Bioimage Benchmark Collection (BBBC)

  • 链接: Broad Bioimage Benchmark Collection (BBBC)

• Broad Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)

  • 链接: Broad Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)

• Cell Image Library

  • 链接: Cell Image Library

• Complete Genomics Public Data

  • 链接: Complete Genomics Public Data

• EBI ArrayExpress

  • 链接: EBI ArrayExpress

• EBI Protein Data Bank in Europe

  • 链接: EBI Protein Data Bank in Europe

• ENCODE project

  • 链接: ENCODE project

• Electron Microscopy Pilot Image Archive (EMPIAR)

  • 链接: Electron Microscopy Pilot Image Archive (EMPIAR)

• Ensembl Genomes

  • 链接: Ensembl Genomes

• Gene Expression Omnibus (GEO)

  • 链接: Gene Expression Omnibus (GEO)

• Gene Ontology (GO)

  • 链接: Gene Ontology (GO)

• Global Biotic Interactions (GloBI)

  • 链接: Global Biotic Interactions (GloBI)

• Harvard Medical School (HMS) LINCS Project

  • 链接: Harvard Medical School (HMS) LINCS Project

• Human Genome Diversity Project

  • 链接: Human Genome Diversity Project

• Human Microbiome Project (HMP)

  • 链接: Human Microbiome Project (HMP)

• ICOS PSP Benchmark

  • 链接: ICOS PSP Benchmark

• International HapMap Project

  • 链接: International HapMap Project

• Journal of Cell Biology DataViewer

  • 链接: Journal of Cell Biology DataViewer

• KEGG

  • 链接: KEGG

• MIT Cancer Genomics Data

  • 链接: MIT Cancer Genomics Data

• NCBI Proteins

  • 链接: NCBI Proteins

• NCBI Taxonomy

  • 链接: NCBI Taxonomy

• NCI Genomic Data Commons

  • 链接: NCI Genomic Data Commons

• NIH Microarray data

  • 链接: NIH Microarray data

• OpenSNP genotypes data

  • 链接: OpenSNP genotypes data

• Pathguid - Protein-Protein Interactions Catalog

  • 链接: Pathguid - Protein-Protein Interactions Catalog

• Protein Data Bank

  • 链接: Protein Data Bank

• Psychiatric Genomics Consortium

  • 链接: Psychiatric Genomics Consortium

• PubChem Project

  • 链接: PubChem Project

• PubGene (now Coremine Medical)

  • 链接: PubGene (now Coremine Medical)

• Sanger Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)

  • 链接: Sanger Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)

• Sanger Genomics of Drug Sensitivity in Cancer Project (GDSC)

  • 链接: Sanger Genomics of Drug Sensitivity in Cancer Project (GDSC)

• Sequence Read Archive(SRA)

  • 链接: Sequence Read Archive(SRA)

• Stanford Microarray Data

  • 链接: Stanford Microarray Data

• Stowers Institute Original Data Repository

  • 链接: Stowers Institute Original Data Repository

• Systems Science of Biological Dynamics (SSBD) Database

  • 链接: Systems Science of Biological Dynamics (SSBD) Database

• The Cancer Genome Atlas (TCGA), available via Broad GDAC

  • 链接: The Cancer Genome Atlas (TCGA), available via Broad GDAC

• The Catalogue of Life

  • 链接: The Catalogue of Life

• The Personal Genome Project

  • 链接: The Personal Genome Project

• UCSC Public Data

  • 链接: UCSC Public Data

• UniGene

  • 链接: UniGene

• Universal Protein Resource (UnitProt)

  • 链接: Universal Protein Resource (UnitProt)

气候与天气

• Actuaries Climate Index

  • 链接: Actuaries Climate Index

• Australian Weather

  • 链接: Australian Weather

• Aviation Weather Center - Consistent, timely and accurate weather [...]

  • 链接: Aviation Weather Center - Consistent, timely and accurate weather [...]

• Brazilian Weather - Historical data (In Portuguese)

  • 链接: Brazilian Weather - Historical data (In Portuguese)

• Canadian Meteorological Centre

  • 链接: Canadian Meteorological Centre

• Climate Data from UEA (updated monthly)

  • 链接: [Climate Data from UEA (updated monthly)](https://crudata.uea.ac.uk/cru/data/temperature/#datter and ftp://ftp.cmdl.noaa.gov/)

• European Climate Assessment & Dataset

  • 链接: European Climate Assessment & Dataset

• Global Climate Data Since 1929

  • 链接: Global Climate Data Since 1929

• NASA Global Imagery Browse Services

  • 链接: NASA Global Imagery Browse Services

• NOAA Bering Sea Climate

  • 链接: NOAA Bering Sea Climate

• NOAA Climate Datasets

  • 链接: NOAA Climate Datasets

• NOAA Realtime Weather Models

  • 链接: NOAA Realtime Weather Models

• NOAA SURFRAD Meteorology and Radiation Datasets

  • 链接: NOAA SURFRAD Meteorology and Radiation Datasets

• The World Bank Open Data Resources for Climate Change

  • 链接: The World Bank Open Data Resources for Climate Change

• UEA Climatic Research Unit

  • 链接: UEA Climatic Research Unit

• WU Historical Weather Worldwide

  • 链接: WU Historical Weather Worldwide

• WorldClim - Global Climate Data

  • 链接: WorldClim - Global Climate Data

复杂网络

• AMiner Citation Network Dataset

  • 链接: AMiner Citation Network Dataset

• CrossRef DOI URLs

  • 链接: CrossRef DOI URLs

• DBLP Citation dataset

  • 链接: DBLP Citation dataset

• DIMACS Road Networks Collection

  • 链接: DIMACS Road Networks Collection

• NBER Patent Citations

  • 链接: NBER Patent Citations

• NIST complex networks data collection

  • 链接: NIST complex networks data collection

• Network Repository with Interactive Exploratory Analysis Tools

  • 链接: Network Repository with Interactive Exploratory Analysis Tools

• Protein-protein interaction network

  • 链接: Protein-protein interaction network

• PyPI and Maven Dependency Network

  • 链接: PyPI and Maven Dependency Network

• Scopus Citation Database

  • 链接: Scopus Citation Database

• Small Network Data

  • 链接: Small Network Data

• Stanford GraphBase

  • 链接: Stanford GraphBase

• Stanford Large Network Dataset Collection

  • 链接: Stanford Large Network Dataset Collection

• Stanford Longitudinal Network Data Sources

  • 链接: Stanford Longitudinal Network Data Sources

• The Koblenz Network Collection

  • 链接: The Koblenz Network Collection

• The Laboratory for Web Algorithmics (UNIMI)

  • 链接: The Laboratory for Web Algorithmics (UNIMI)

• The Nexus Network Repository

  • 链接: The Nexus Network Repository

• UCI Network Data Repository

  • 链接: UCI Network Data Repository

• UFL sparse matrix collection

  • 链接: UFL sparse matrix collection

• WSU Graph Database

  • 链接: WSU Graph Database

计算机网络

• 3.5B Web Pages from CommonCrawl 2012

  • 链接: 3.5B Web Pages from CommonCrawl 2012

• 53.5B Web clicks of 100K users in Indiana Univ.

  • 链接: 53.5B Web clicks of 100K users in Indiana Univ.

• CAIDA Internet Datasets

  • 链接: CAIDA Internet Datasets

• CRAWDAD Wireless datasets from Dartmouth Univ.

  • 链接: CRAWDAD Wireless datasets from Dartmouth Univ.

• ClueWeb09 - 1B web pages

  • 链接: ClueWeb09 - 1B web pages

• ClueWeb12 - 733M web pages

  • 链接: ClueWeb12 - 733M web pages

• CommonCrawl Web Data over 7 years

  • 链接: CommonCrawl Web Data over 7 years

• Criteo click-through data

  • 链接: Criteo click-through data

• Internet-Wide Scan Data Repository

  • 链接: Internet-Wide Scan Data Repository

• OONI: Open Observatory of Network Interference - Internet censorship data

  • 链接: OONI: Open Observatory of Network Interference - Internet censorship data

• Open Mobile Data by MobiPerf

搜集汇总

数据集介绍

构建方式

该数据集是通过自动化脚本从多个来源收集和整理而成的，涵盖了各种领域的公共数据集。数据集的构建主要依赖于apd-core这一自动化工具，从不同的数据源中抓取数据，并进行分类整理。

特点

该数据集的特点在于其全面性和多样性，包含了从农业、生物学到地理信息系统等众多领域的公共数据集。此外，数据集还提供了丰富的元数据信息，便于用户理解和使用。

使用方法

用户可以通过GitHub页面浏览和搜索数据集，根据需求下载数据。每个数据集都提供了详细的描述和元数据，方便用户了解数据集的来源、结构和使用方式。

背景与挑战

背景概述

多个数据集是一个集合，涵盖了不同领域的高质量公共数据源。这些数据集由 awesomedata 组织自动生成，旨在为研究者和开发者提供方便的数据访问途径。数据集包括农业、生物学、气候与天气、复杂网络、计算机网络、数据挑战、地球科学、经济学、教育、能源、金融、GIS等多个领域，每个领域下又包含了多个具体的数据集。这些数据集的创建，旨在推动相关领域的研究与应用，为学术界和工业界提供宝贵的信息资源。

当前挑战

尽管这些数据集为研究提供了极大的便利，但在使用过程中也面临一些挑战。首先，数据集的构建过程中如何确保数据的准确性和一致性是一个挑战。其次，不同数据集之间的异构性，即数据格式和结构的差异性，给数据的整合和分析带来了困难。此外，部分数据集可能存在更新不及时、数据质量参差不齐的问题。最后，对于某些领域，如金融和地理信息系统，数据的可用性和访问权限可能受到限制，这为研究带来了额外的挑战。

常用场景

经典使用场景

多个数据集涵盖了不同领域的公共数据资源，经典使用场景包括生物信息学研究、气候变化分析、社交网络分析、地理信息系统应用等。这些数据集被广泛用于学术研究、商业分析和政策制定中。

解决学术问题

该数据集集合解决了多个学术研究问题，如基因组学数据分析、蛋白质结构预测、社交网络演化分析、气候模式模拟等，为相关领域的研究提供了宝贵的数据资源。

衍生相关工作

多个数据集的发布催生了大量相关的工作，包括数据挖掘竞赛、学术论文发表、商业分析报告等，推动了数据科学领域的发展。