TARGET: Osteosarcoma (OS)

There are 93 fully characterized patient cases that make up the TARGET OS dataset, each with gene expression, tumor and paired normal copy number analyses, methylation, miRNA profiles, along with comprehensive next-generation sequencing to include mRNA-seq and exome sequencing (whole genome sequencing where available). There are additional cases with partial molecular characterization and/or sequencing data available, making this an informative genomic dataset. All cases can be sorted according to data type via the Case Matrix on the TARGET Data Matrix. Please visit the TARGET website listed above for additional information on this and other TARGET genomics projects. Please see the TARGET Publication Guidelines at the OCG websitefor updated details on sharing of any TARGET substudy data.

本TARGET骨肉瘤（TARGET OS）数据集包含93例完成完整分子特征鉴定的患者病例，每例病例均配有基因表达、肿瘤与配对正常样本拷贝数分析、甲基化谱、microRNA（miRNA）谱数据，以及涵盖mRNA测序（mRNA-seq）、外显子组测序（exome sequencing）的全面下一代测序（next-generation sequencing, NGS）数据，若条件允许则额外提供全基因组测序（whole genome sequencing）数据。另有部分病例仅完成部分分子特征分析或仅可获取其测序数据，使得该数据集成为极具参考价值的基因组学数据集。所有病例均可通过TARGET数据矩阵（TARGET Data Matrix）中的病例矩阵，依据数据类型进行筛选排序。请访问上文提及的TARGET官方网站，以获取本数据集及其他TARGET基因组学项目的更多详细信息。请查阅OCG官网发布的TARGET出版指南，以获取关于任何TARGET子研究数据共享的最新细则。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是TARGET骨肉瘤（OS）项目的一部分，包含93个完全表征的患者病例，提供全面的多组学数据，如基因表达、拷贝数分析、甲基化、miRNA谱和下一代测序（包括mRNA-seq和外显子测序），旨在支持骨肉瘤的基因组研究。数据集还包括额外部分表征的病例，总计622个样本、1404个实验和1428个运行，由Jackson Laboratories组织，于2009年12月发布，具有医学研究价值。