WDSPdb

WD40-repeat protein Structure Predictor (WDSP) is developed to identify WD40 repeats and predict the secondary structures of WD40 domains based on their primary sequences. WDSPdb is a database containing all the WD40 proteins' secondary structures, tetrad hydrogen bond networks, interaction hotspots annotated by WDSP. WDSPdb can be accessed at http://www.wdspdb.com/wdsp/ or http://wu.scbb.pkusz.edu.cn/wdsp/.WD40重复序列蛋白结构预测器（WD40-repeat protein Structure Predictor，WDSP）旨在基于蛋白质一级序列识别WD40重复序列，并预测WD40结构域的二级结构。WDSPdb是一个收录经WDSP注释的全部WD40蛋白二级结构、四联体氢键网络及相互作用热点的数据库。用户可通过http://www.wdspdb.com/wdsp/ 或 http://wu.scbb.pkusz.edu.cn/wdsp/ 访问该数据库。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

WDSPdb是一个免费且全面的数据库，专门基于WDSP工具为WD40结构域提供准确的结构预测和特征位点注释。它记录了来自4426个物种的约60万个预测WD40蛋白，包括二级结构、氢键网络和相互作用热点等信息。