多能性相关lncRNA Osilr9所结合的染色质DNA测序

体细胞核重编程成为多能状态有可能为再生医学提供患者特异性多能干细胞（iPSCs）。然而，目前，这种多能性重编程背后的表观遗传机制还知之甚少。为了描述这种表观遗传调控网络，我们利用染色质RNA原位逆转录测序（CRIST-seq）方法来识别嵌在干细胞核心因子基因的三维染色体内结构中的长非编码RNA（lncRNAs）。通过结合CRIST -seq和RNA-seq，我们确定Osilr9 （Oct4-Sox2相互作用的lncRNA 9）是一个多能性相关的lncRNA。Osilr9表达与干细胞重编程多能性状态相关。通过shRNA敲低，我们证明了该lncRNA是维持干细胞多能性的最佳条件。Osilr9的过表达诱导成纤维细胞内源性干细胞核心因子基因的稳健激活。Osilr9参与了维持多能性所需的染色体内环的形成。与Oct4启动子结合后，Osilr9招募DNA去甲基酶TET1，导致启动子去甲基化。这些数据表明，Osilr9是一个关键的染色质表观遗传调节剂，协调核心干细胞因子基因的启动子活性，突出了多能性相关lncrna在干细胞多能性和重编程中的关键作用。