LC-TIMS-ToF, nLC-TIMS-ToF and nLC-MS/MS data for histone PTM identification

The dataset includes LC-TIMS-PASEF-ToF MS/MS (timsTOF Pro2), nLC-TIMS-PASEF-ToF MS/MS (timsTOF Pro2), and nLC-MS/MS (Exploris 240) of propionylated bottom-up histone peptides from recombinant histones (standards), HeLa cells, and HeLa + HDACi cells.

本数据集包含三类质谱检测数据，均针对源自重组组蛋白（标准品）、HeLa细胞以及经组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）处理的HeLa细胞的丙酰化鸟枪法组蛋白肽段，具体检测方法及仪器如下：液相色谱-离子迁移谱-平行累积连续碎裂-飞行时间串联质谱（LC-TIMS-PASEF-ToF MS/MS，timsTOF Pro2）、纳升液相色谱-离子迁移谱-平行累积连续碎裂-飞行时间串联质谱（nLC-TIMS-PASEF-ToF MS/MS，timsTOF Pro2），以及纳升液相色谱-串联质谱（nLC-MS/MS，Exploris 240）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含用于组蛋白翻译后修饰（PTM）鉴定的质谱数据，涵盖LC-TIMS-ToF、nLC-TIMS-ToF和nLC-MS/MS三种技术平台，数据来源于重组组蛋白标准品、HeLa细胞及HeLa+HDACi细胞样本。数据集包含18个公开文件，主要为ZIP归档和位图图像格式，文件大小较大（最大达605 MB），适用于化学和生命科学领域的研究，并采用CC0 1.0许可证允许自由使用。