SaProtHub/Dataset-Beta_Lactamase-PEER

β-Lactamase Prediction数据集研究的是TEM-1 beta-lactamase蛋白质的一阶突变体的活性。目标变量y是一个实验测试的适应度分数，记录了每个突变体的缩放突变效应。数据集包含4158个训练样本、520个验证样本和520个测试样本。所有数据以LMDB格式组织，每个样本包含一个结构感知的序列和对应的适应度标签。

原始信息汇总

数据集概述

数据集名称

β-Lactamase Prediction

数据集描述

该数据集研究TEM-1 beta-lactamase蛋白的第一级突变体的活性。目标变量y ∈ R 是实验测试的适应性评分，记录每个突变体的缩放突变效应。

数据集分割

• 训练集: 4158
• 验证集: 520
• 测试集: 520

数据格式

数据组织在LMDB格式中，数据库架构包括：

• 长度: 样本数量
• 0:
  • seq: 结构感知序列
  • fitness: 序列的适应性标签
• 1:
  • ...

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集用于β-内酰胺酶活性预测，专注于TEM-1 beta-lactamase蛋白质的一阶突变体研究。数据集包含5,198个样本，分为训练、验证和测试集，每个样本包括蛋白质序列和对应的实验适应度分数，适用于蛋白质序列理解和突变效应预测任务。