定量测定染色质结合蛋白相分离特征-002

近两年，液-液相分离（liquid-liquid phase-separation, LLPS）被认为是染色质高级结构以及生物大分子凝聚体重要的组装方式。然而，现有LLPS研究手段都是低通量以及定性检测手段为主，我们使用Hi-MS定量测定K562细胞中1,6-HD 处理前后的染色质结合蛋白，从而得到了anti-1,6-HD index of chromatin associated proteins (AICAP)，使用该指数，我们第一次在蛋白组水平定量测定蛋白相分离特征，第一次把蛋白组与染色质高级结构整合起来，研究相分离对它们的影响，并且发现，常染色质的染色质构象与蛋白组成都受LLPS 干扰剂1,6-HD影响更大。总共数据量为14GB

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集通过Hi-MS技术定量测定K562细胞中1,6-HD处理前后的染色质结合蛋白，获得了AICAP指数，首次在蛋白组水平实现了蛋白相分离特征的定量分析，并揭示了液-液相分离对染色质高级结构及常染色质的影响。数据总量为14GB。