Profiling of AKVPL vs AKVPSL derived tumor cells (Mouse)

RNA was isolated from fluorescence activated cell sorted (FACS) Lgr5-GFP+ and Lgr5-GFP- from aged matched subcutaneously implanted Apcmin/+;KrasLSL-G12D/+;VillinCre; Lgr5DTReGFP;p53KO (AKVPL) and Apcmin/+;KrasLSL-G12D/+;VillinCre; Lgr5DTReGFP;p53KO;SMAD4KO (AKVPSL) intestinal tumours."SAMPLE_ID" sample characteristic is a sample identifier internal to Genentech.The ID of this project in Genentech's ExpressionPlot database is PRJ0009421从年龄匹配的皮下移植型Apcmin/+;KrasLSL-G12D/+;VillinCre;Lgr5DTReGFP;p53KO（缩写为AKVPL）与Apcmin/+;KrasLSL-G12D/+;VillinCre;Lgr5DTReGFP;p53KO;SMAD4KO（缩写为AKVPSL）肠道肿瘤中，通过荧光激活细胞分选（Fluorescence Activated Cell Sorting，FACS）分离得到Lgr5-GFP阳性与阴性细胞的RNA。"SAMPLE_ID"为样本特征项，是基因泰克（Genentech）内部使用的样本标识符。本项目在基因泰克的ExpressionPlot数据库中的项目编号为PRJ0009421。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是一个小鼠肿瘤细胞RNA测序数据集，专注于比较两种基因工程模型（AKVPL和AKVPSL）的肠道肿瘤细胞，使用荧光激活细胞分选技术分离Lgr5-GFP+和Lgr5-GFP-细胞进行转录组分析。数据集包含16个样本，总大小21.07 GB，基于Illumina HiSeq 2500平台生成，适用于研究癌症生物学和基因突变对肿瘤细胞的影响。