Indicateurs sur les variants Covid-19

Les analyses concernant les variants portent sur les données relatives aux suspicions ou aux résultats de criblage suite à une PCR ou un test antigénique (TA) positif.Les données sont rapportées à l’ensemble des tests positifs réalisés (RT-PCR + TA), et non à un nombre de personnes. En effet la définition des personnes pour le calcul des indicateurs ne retient qu’un seul test pour une personne dans une période donnée, alors que cette dernière peut s’être fait tester plusieurs fois (test TA, suivi par un PCR par exemple) L’objectif de l’analyse de ces données est de suivre la circulation sur le territoire des variants d’intérêt, qui concernent à ce jour les variants :Royaume-Uni (UK): code Nexstrain= 20I/501Y.V1Afrique du Sud (ZA) : code Nexstrain= 20H/501Y.V2Brésil (BR) : code Nexstrain= 20J/501Y.V3Données par semaine glissante diffusées par département, région et france.Les variables :Semaine = Semaine glissantecl_age90 = Classe d’âgeNb_tests_PCR_TA_crible = Nombre de tests PCR criblés parmi les PCR positivesPrc_tests_PCR_TA_crible = % de tests PCR criblés parmi les PCR positivesNb_susp_501Y_V1 = Nombre de tests avec suspicion de variant 20I/501Y.V1 (UK)Prc_susp_501Y_V1 = % de tests avec suspicion de variant 20I/501Y.V1 (UK)Nb_susp_501Y_V2_3 = Nombre de tests avec suspicion de variant 20H/501Y.V2 (ZA) ou 20J/501Y.V3 (BR)Prc_susp_501Y_V2_3 = % de tests avec suspicion de variant 20H/501Y.V2 (ZA) ou 20J/501Y.V3 (BR)Nb_susp_IND = Nombre de tests avec une détection de variant mais non identifiablePrc_susp_IND = % de tests avec une détection de variant mais non identifiableNb_susp_ABS = Nombre de tests avec une absence de détection de variantPrc_susp_ABS = % de tests avec une absence de détection de variantLes classes d’âge :• 0 tous âges• 09 0-9 ans• 19 10-19 ans• 29 20-29 ans• 39 30-39 ans• 49 40-49 ans• 59 50-59 ans• 69 60-69 ans• 79 70- 79 ans• 89 80-89 ans• 90 90 ans et plus

本分析针对变异株的研究聚焦于PCR或抗原检测（TA）呈阳性后的疑似或检测结果相关数据。数据统计基于所有阳性检测结果（包括RT-PCR与TA），而非个人数量。实际上，在计算指标时，针对个人的定义仅考虑在一定时期内进行的单一测试，尽管该个体可能多次接受检测（如先进行TA检测，随后进行PCR检测等）。分析此数据的目标是追踪具有地域分布的变异株的传播情况，目前涉及的变异株包括：英国（UK）：Nextrain代码=20I/501Y.V1；南非（ZA）：Nextrain代码=20H/501Y.V2；巴西（BR）：Nextrain代码=20J/501Y.V3。数据按周滑动分布，按部门、地区及全国范围发布。涉及的变量包括：

- 周次：滑动周次
- cl_age90：年龄分级
- Nb_tests_PCR_TA_crible：在阳性PCR检测中进行的筛查PCR测试数量
- Prc_tests_PCR_TA_crible：在阳性PCR检测中筛查PCR测试的百分比
- Nb_susp_501Y_V1：怀疑存在20I/501Y.V1（UK）变异株的测试数量
- Prc_susp_501Y_V1：怀疑存在20I/501Y.V1（UK）变异株的测试百分比
- Nb_susp_501Y_V2_3：怀疑存在20H/501Y.V2（ZA）或20J/501Y.V3（BR）变异株的测试数量
- Prc_susp_501Y_V2_3：怀疑存在20H/501Y.V2（ZA）或20J/501Y.V3（BR）变异株的测试百分比
- Nb_susp_IND：检测到变异株但无法识别的测试数量
- Prc_susp_IND：检测到变异株但无法识别的测试百分比
- Nb_susp_ABS：未检测到变异株的测试数量
- Prc_susp_ABS：未检测到变异株的测试百分比

年龄分级如下：
- 0：所有年龄段
- 09：0-9岁
- 19：10-19岁
- 29：20-29岁
- 39：30-39岁
- 49：40-49岁
- 59：50-59岁
- 69：60-69岁
- 79：70-79岁
- 89：80-89岁
- 90：90岁及以上