Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with propylamycin and bound to mRNA and A-, P-, and E-site tRNAs at 2.75A resolution

Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with propylamycin and bound to mRNA and A-, P-, and E-site tRNAs at 2.75A resolution Descriptor: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-3-hydroxyc yclohexyl 2-amino-2,4-dideoxy-4-propyl-alpha-D-glucopyranoside, 16S Ribosomal RNA, 23S Ribosomal RNA, ... Authors: Matsushita, T, Sati, G.C, Kondasinghe, N, Pirrone, M.G, Kato, T, Waduge, P, Kumar, H.S, Sanchon, A.C, Dobosz-Bartoszek, M, Shcherbakov, D, Juhas, M, Hobbie, S.N, Schrepfer, T, Chow, C.S, Polikanov, Y.S, Schacht, J, Vasella, A, Bottger, E.C, Crich, D. Deposit date: 2019-03-13 Release date: 2019-04-17 Last modified: 2025-03-19 Method: X-RAY DIFFRACTION (2.75 Å) Cite: Design, Multigram Synthesis, and in Vitro and in Vivo Evaluation of Propylamycin: A Semisynthetic 4,5-Deoxystreptamine Class Aminoglycoside for the Treatment of Drug-Resistant Enterobacteriaceae and Other Gram-Negative Pathogens. J. Am. Chem. Soc., 141, 2019

嗜热栖热菌（Thermus thermophilus）70S核糖体与丙氨霉素（propylamycin）形成复合物，并结合信使RNA（mRNA）以及A、P、E位点转运RNA（tRNAs）的晶体结构，分辨率为2.75埃（Å）。
描述符：(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二氨基-2-{[3-O-(2,6-二氨基-2,6-二脱氧-β-L-艾杜吡喃糖基)-β-D-呋喃核糖基]氧基}-3-羟基环己基 2-氨基-2,4-二脱氧-4-丙基-α-D-吡喃葡萄糖苷、16S核糖体RNA（16S Ribosomal RNA）、23S核糖体RNA（23S Ribosomal RNA）等。
作者：Matsushita, T、Sati, G.C、Kondasinghe, N、Pirrone, M.G、Kato, T、Waduge, P、Kumar, H.S、Sanchon, A.C、Dobosz-Bartoszek, M、Shcherbakov, D、Juhas, M、Hobbie, S.N、Schrepfer, T、Chow, C.S、Polikanov, Y.S、Schacht, J、Vasella, A、Bottger, E.C、Crich, D.
存储日期：2019年3月13日；发布日期：2019年4月17日；最后修改日期：2025年3月19日
实验方法：X射线衍射（X-RAY DIFFRACTION），分辨率2.75埃
引用文献：《丙氨霉素的设计、多克级合成及体外与体内评价：一种用于治疗耐药肠杆菌科及其他革兰氏阴性病原菌的半合成4,5-脱氧链霉素类氨基糖苷类化合物》，发表于《美国化学会志》（J. Am. Chem. Soc.），2019年，第141卷。