细胞多能性退出lncRNA Peln1所结合的染色质DNA测序

干细胞如何退出多能性的分子机制在很大程度上仍不清楚。利用染色质RNA原位逆转录测序，我们发现Peln1是干细胞相关主要的转录因子Oct4启动子染色质复合物中的一个新的RNA组分。在体细胞重编程过程中，Peln1与多能性状态呈负相关。Peln1过表达可导致E14细胞退出多能性，而Peln1敲低更容易诱导重编程。在机制上，我们发现Peln1与Oct4启动子相互作用并招募DNA甲基转移酶DNMT3A。通过从头改变Oct4启动子中的表观基因型，Peln1破环了维持多能性所需的染色体内环。利用RNA逆转录相关破获测序，我们发现Peln1靶向多个与干细胞自我更新相关的通路。这些发现表明Peln1可以作为一个新的表观遗传参与者，并利用反式作用机制诱导干细胞退出多能状态。