西太平洋M4浅海山的五个站位的细菌原始数据集

国家海洋科学数据中心2025-09-17 更新2025-09-20 收录

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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1968144179225735170&otherId=1968144179229929474

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西太平洋 M4 浅海海山区域的五个站位采集的水体样本。使用试剂盒提取 DNA 和 RNA，用引物U341F和R685扩增原核微生物的16S rRNA基因 V4区。为防止误差，每个样本都要进行三次 PCR 扩增，并使用 Illumina HiSeq 平台对合格样本进行测序。获取原始序列数据集。对测序后得到的原始数据通过VSEARCH进行引物的去除和质量控制。通过USEARCH去噪处理，获得扩增子变异序列zOTUs。序列注释选用rdp_16s_v18数据库。