Codon Usage Tabulated from GenBank

Codon usage in individual genes has been calculated using the nucleotide sequence data obtained from the GenBank Genetic Sequence Database. The compilation of codon usage is synchronized with each major release of GenBank.

单个基因中的密码子使用情况已通过从GenBank遗传序列数据库获取的核酸序列数据计算得出。密码子使用的汇编与GenBank的每一次主要版本发布保持同步。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集基于NCBI-GenBank Flat File Release 160.0（2007年6月15日），汇总了35,799个生物体的3,027,973个完整蛋白质编码基因的密码子使用情况。它提供基于生物体拉丁名称的查询功能、字母顺序列表，以及FTP分发和附加程序，主要用于生物信息学中的密码子使用模式分析。