Extended Diversity Analysis of Cultivated Grapevine Vitis vinifera with 10K genome-wide SNPs
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The dataset, comprising 10207 SNPs for 783 grape cultivars and without missing data, is made available here in support of the paper : Laucou V, Launay A, Bacilieri R, Lacombe T, Adam-Blondon AF, Bérard A, Brunel D, Chauveau A, Ibañez J, Le Paslier MC, Maghradze D, Martinez-Zapater JM, Maul E, Töpfer R, Péros JP, Boursiquot JM, 2017. Extended Diversity Analysis of Cultivated Grapevine Vitis vinifera with 10K genome-wide SNPs. Submitted to PlosOne, 2017. Plant material used in the study was harvested in four grapevine collections (FAO WIEWS instcode FRA139, ESP080, ESP217, DEU098), respectively: - France, “INRA Domaine de Vassal, Marseillan-Plage” http://www6.montpellier.inra.fr/vassal - Spain, “IMIDRA Finca El Encin, Madrid” http://www.madrid.org/coleccionvidencin - Spain, “ICVV, Logroño” http://www.icvv.es - Germany, “JKI Geilweilerhof, Siebeldingen” http://www.deutsche-genbank-reben.jki.bund.de
本数据集包含783个葡萄品种的10207个单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNPs），且无缺失数据，现已公开以支持以下论文：Laucou V、Launay A、Bacilieri R、Lacombe T、Adam-Blondon AF、Bérard A、Brunel D、Chauveau A、Ibañez J、Le Paslier MC、Maghradze D、Martinez-Zapater JM、Maul E、Töpfer R、Péros JP、Boursiquot JM，2017年。《基于10K全基因组单核苷酸多态性的栽培葡萄（Vitis vinifera）多样性扩展分析》，提交至《PLOS ONE》，2017年。 本研究使用的植物材料采自四个葡萄种质资源库（FAO WIEWS机构代码：FRA139、ESP080、ESP217、DEU098），具体如下： - 法国："INRA Domaine de Vassal, Marseillan-Plage"，网址：http://www6.montpellier.inra.fr/vassal - 西班牙："IMIDRA Finca El Encin, Madrid"，网址：http://www.madrid.org/coleccionvidencin - 西班牙："ICVV, Logroño"，网址：http://www.icvv.es - 德国："JKI Geilweilerhof, Siebeldingen"，网址：http://www.deutsche-genbank-reben.jki.bund.de
