Agnodice
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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Agnodice incorporates thousands of bacterial sRNA-RNA interactions derived from a diverse set of experimental methodologies including state-of-the-art Deep Sequencing interactome identification techniques. It comprises 39,600 entries which are annotated at strain-level resolution and pertain to 399 sRNAs and 12,137 target RNAs identified in 71 bacterial strains.
Agnodice 数据集收录了数千条细菌小RNA（small RNA，sRNA）与RNA的相互作用对，其数据来源于涵盖前沿深度测序（Deep Sequencing）相互作用组鉴定技术在内的多样化实验方法体系。该数据集共计39600条记录，所有记录均以菌株级分辨率完成注释，涉及71个细菌菌株中鉴定得到的399个sRNA以及12137个靶RNA。
提供机构：
色萨利大学搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
Agnodice是一个精心整理的细菌sRNA-RNA相互作用数据库，包含39,600个条目，涉及399个sRNAs和12,137个目标RNAs，覆盖71个细菌菌株。所有数据均基于实验支持，整合了多种高通量和低通量方法，并提供统一的注释和丰富元数据。
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