Table S1 - Insight into the Wild Origin, Migration and Domestication History of the Fine Flavour Nacional <em>Theobroma cacao</em> L. Variety from Ecuador

Origin, collection, % heterozygosity and status of the 176 T. cacao accessions analysed in the present study. CATIE: Centro Agronomico Tropical de Investigación y Ensenanza (Costa Rica); CIC: Centro de Investigación Caribia (Colombia); CIRAD/Mpl: Centre de Coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (France)/Montpellier Centre; CNRA: Centre National de Recherches Agronomiques (Côte d’Ivoire); CRU: Cocoa research Unit – University of the West Indies (Trinidad and Tobago); EET-P: Estación Experimental Tropical-Pichilingue (Ecuador); FONAIAP: Fondo Nacional de Investigaciones Agropecuarias (Venezuela); INTA: Instituto Nicaraguense de Tecnologìa Agropecuario (Nicaragua); INIFAP: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales. Agrícolas y Pecuarias (Mexico). The % of heterozygosity was evaluated by 80 SSR (as reported in Table 2). (DOCX)