Slide-seqV2

Dataset nameAbbreviationNo. of spots/cellsNo. of genesNo. of clustersMouse kidney diabete (Puck_191206_03)Slide-seqV2_MKD185422019014Mouse kidney normal (Puck_200104_03)Slide-seqV2_MKN160271928313Mouse embryo E8.5Slide-seqV2_embryo84252755416

数据集名称 数据集缩写 斑点数量 基因数量 聚类簇数量
小鼠糖尿病肾脏（Puck_191206_03） Slide-seqV2_MKD 18542 20190 14
小鼠正常肾脏（Puck_200104_03） Slide-seqV2_MKN 16027 19283 13
小鼠胚胎E8.5期 Slide-seqV2_embryo 8425 27554 16

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Slide-seqV2数据集包含三个小鼠转录组子数据集，涵盖糖尿病肾脏、正常肾脏和胚胎E8.5的组织样本，每个子集均提供详细的spots/cells、基因和聚类数量信息。数据集适用于基因组学和转录组学研究，采用CC BY 4.0许可协议。