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D276G DNA polymerase beta substrate complex with templating adenine and incoming Fapy-dGTP analog

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Protein Data Bank Japan2023-10-11 更新2026-03-21 收录
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D276G DNA polymerase beta substrate complex with templating adenine and incoming Fapy-dGTP analog Descriptor: 1,2-ETHANEDIOL, 1-[2-amino-5-(formylamino)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-4-yl]-2,5-anhydro-1,3-dideoxy-6-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-D-ribo-hexitol, CALCIUM ION, ... Authors: Freudenthal, B.D, Smith, M.R, Wilson, S.H, Beard, W.A. Deposit date: 2018-10-11 Release date: 2019-01-30 Last modified: 2023-10-11 Method: X-RAY DIFFRACTION (1.897 Å) Cite: A guardian residue hinders insertion of a Fapy•dGTP analog by modulating the open-closed DNA polymerase transition. Nucleic Acids Res., 47, 2019

D276G突变型β-DNA聚合酶(DNA polymerase beta)与模板腺嘌呤及掺入型Fapy-dGTP类似物构成的底物复合物 配体表征:1,2-乙二醇、1-[2-氨基-5-(甲酰胺基)-6-氧代-1,6-二氢嘧啶-4-基]-2,5-脱水-1,3-二脱氧-6-O-[(R)-羟基{[(R)-羟基(膦酰氧基)膦酰基]氧基}膦酰基]-D-核糖己糖醇、钙离子…… 作者:Freudenthal, B.D.、Smith, M.R.、Wilson, S.H.、Beard, W.A. 提交日期:2018年10月11日 发布日期:2019年1月30日 最后修改日期:2023年10月11日 实验方法:X射线衍射(X-RAY DIFFRACTION),解析分辨率为1.897埃 引用文献:《通过调控DNA聚合酶开闭构象转变,守护残基阻碍Fapy•dGTP类似物的掺入》,《核酸研究(Nucleic Acids Research)》,第47卷,2019年
创建时间:
2018-10-11
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