MPRAVarDB

MPRAVarDB is a specialized database and web server for exploring regulatory effects of 242,818 genetic variants from 18 MPRA experiments across >30 cell lines and 30 diseases/traits. It enables variant queries by genomic region, disease, or cell type, and provides pretrained machine-learning models to predict regulatory impacts in disease/cell-specific contexts.

MPRAVarDB是一款专用数据库与网页服务器，用于探究来自18项大规模平行报告基因实验（MPRA）的242818个遗传变异的调控效应，这些实验覆盖逾30种细胞系与30种疾病/性状。该数据库支持通过基因组区域、疾病或细胞类型开展变异查询，并提供预训练机器学习模型，以预测疾病或细胞特异性情境下的调控影响。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MPRAVarDB是一个包含242,818个遗传变异的数据库，专注于探索变异在32种细胞系和37种疾病中的调控效应，提供查询功能和预训练机器学习模型，支持单查询、批量查询及预测分析。