APPRIS

The APPRIS database uses protein structural and functional features and information from cross-species conservation to annotate splice isoforms in protein-coding genes. It selects a single protein isoform, the ‘principal’ isoform, as the reference for each gene based on these annotations. A single main splice isoform reflects the biological reality for most protein coding genes and APPRIS principal isoforms are the best predictors of these main proteins isoforms.APPRIS数据库（APPRIS database）通过整合蛋白质结构与功能特征以及跨物种保守性信息，对蛋白编码基因中的剪接异构体进行注释。该数据库将基于上述注释信息，为每个基因遴选单一蛋白质异构体——即"主（principal）"异构体——作为该基因的参考序列。对于绝大多数蛋白编码基因而言，单一主要剪接异构体契合其生物学实际，而APPRIS主异构体正是这类主要蛋白质异构体的最佳预测结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

APPRIS数据库利用蛋白质结构、功能和跨物种保守性信息，注释蛋白质编码基因中的剪接异构体，并为每个基因选定一个主要异构体作为参考。这一选择反映了大多数基因的生物学现实，APPRIS的主要异构体是这些主要蛋白质异构体的最佳预测指标。