BPPalign: Aligning RNA secondary structure probabilities to discover new motifs
收藏simtk.org2011-10-21 更新2025-03-26 收录
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资源简介：
This tool provides basic scripts to run the partition executable RNAstructure on hundreds of homolog sequences from RFAM, and to then visualize the results by averaging across these matrices. Examples from purine-binding and double glycine-binding riboswitches are included. <br/><br/>This project includes the following software/data packages: <br/> <ul> <li> <a href="https://simtk.org/frs?group_id=677#pack_1127">BPPalign v0.6 </a> : BPPalign, updated with better examples/documentation (Oct. 2011). </li> </ul>
本工具提供基础脚本，用于在RFAM中数百个同源序列上运行RNA结构分析程序RNAstructure，并通过对这些矩阵的平均处理来可视化结果。其中包含了嘌呤结合和双甘氨酸结合核糖开关的示例。项目包含以下软件/数据包：
<ul>
<li><a href="https://simtk.org/frs?group_id=677#pack_1127">BPPalign v0.6</a> : 更新了更佳的示例/文档的BPPalign（2011年10月）。</li>
</ul>
提供机构：
SimTK
