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SMC aims to provide a comprehensive, tool-agnostic repository of BGC sequence data drawn from all publicly available and user-submitted bacterial and archaeal genome and contig sources. On the website, users are provided a searchable catalog of putative BGCs identified from each source, along with visualizations of gene and domain annotations derived from multiple sequence analysis tools. SMC's data is also available through publicly-accessible application programming interface (API) endpoints to facilitate programmatic access.

SMC旨在构建一套全面且与分析工具无关的生物合成基因簇(Biosynthetic Gene Cluster, BGC)序列资源库,其数据源自所有公开可用及用户提交的细菌、古菌基因组与重叠群来源。在其官方网站中,用户可获取来自各来源的推定BGC可检索目录,同时获得基于多序列分析工具得到的基因与结构域注释可视化结果。此外,SMC的数据还可通过公开可访问的应用程序编程接口(API)端点获取,以支持程序化访问。

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背景与挑战
背景概述
SMC是一个全面的、工具无关的生物合成基因簇(BGC)序列数据存储库,整合了所有公开可用和用户提交的细菌与古菌基因组及contig来源。它提供可搜索的BGC目录、基因和结构域注释可视化,并通过公开API支持程序化访问。
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