2014-2018年华南地区地方猪种线粒体SNP分子标记信息数据集
收藏国家地球系统科学数据中心2020-05-09 更新2024-03-04 收录
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https://www.geodata.cn/data/datadetails.html?dataguid=214893992985755&docId=13815
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资源简介：
本数据集针对我国华南地区，包括福建、广东、广西和海南等部分地区，测序了2014-2018年12个不同地方猪的全基因组重测序数据36头，同时从NCBI数据库下载的3个华南地区猪种18个样本的全基因组重测序数据。然后，通过重测序数据比对到猪的线粒体参考基因组上，得到54条新的华南地方猪品种的线粒体全长序列数据。线粒体基因组全长序列通过GATK软件进行SNP位点检测，最后整理、综合分析得到猪的全基因组SNP分子标记数据集，共含有59个SNPs。根据现有数据的收集情况进行持续补充和完善。
提供机构：
科技基础性工作专项
创建时间：
2020-05-06
