Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA

Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA Descriptor: (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name), Isoform 2B of GTPase KRas, MAGNESIUM ION, ... Authors: Zhang, D, Saldajeno-Concar, M, Tomlinson, A.C.A, Yano, J.K, Knox, J.E. Deposit date: 2024-07-24 Release date: 2025-07-23 Last modified: 2025-08-06 Method: X-RAY DIFFRACTION (1.29 Å) Cite: A neomorphic protein interface catalyzes covalent inhibition of RAS G12D aspartic acid in tumors. Science, 389, 2025RMC-9945、KRAS G12D和亲环蛋白A（Cyclophilin A, CypA）的三元复合物，其化学结构描述符为：(2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-环丙基-2-(甲氨基)丙酰基]-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-基}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-环丙基哌嗪-1-基)-2-[(1R)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-17,17-二甲基-8,14-二氧代-21-(2,2,2-三氟乙基)-15-氧杂-4-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]二十八碳-1(24),2,5(28),19,22,25-六烯-7-基]-3-甲基丁酰胺（非推荐命名）；样本包含GTP酶KRas同工型2B、镁离子（MAGNESIUM ION）等组分。 作者：Zhang, D、Saldajeno-Concar, M、Tomlinson, A.C.A、Yano, J.K、Knox, J.E. 存档日期：2024-07-24 发布日期：2025-07-23 最后修改日期：2025-08-06 实验方法：X射线衍射（分辨率1.29 Å） 引用文献：《肿瘤中新型蛋白质界面催化RAS G12D天冬氨酸的共价抑制作用》，《科学》（Science），2025年，第389卷