Compilation of a Phanerozoic Foraminiferal Test Size Dataset and Investigation of Body Size Evolution

本次上传所有数据均用于本人的博士毕业论文《显生宙有孔虫壳体大小数据集构建与体型演化》 (英文名称:Compilation of a Phanerozoic Foraminiferal Test Size Dataset and Investigation of Body Size Evolution)附件,文件分别为: 附表1 显生宙各纪有孔虫多样性 附表2 显生宙各世有孔虫多样性 附表3 显生宙各阶有孔虫多样性 附表4 显生宙有孔虫大小数据库中有孔虫亚目、属、种数统计合集 附件5 有孔虫大小数据采集地现代经纬度分布气泡图R代码 附件6 有孔虫大小数据古地理图分布R代码 附表7 地史时期各阶有孔虫种的大小变化,包括年龄(由各阶时间中值计算所得)、有孔虫种平均值、标准差、标准误和95%置信区间 附表8 有孔虫大小演化模型比较:基于贝叶斯信息准则(BIC)的模型权重与后验概率,本表汇总了显生宙时期六种有孔虫大小演化模型的比较结果。各模型在结构假设上存在差异,包括是否采用一层或两层结构,以及所使用的过程类型(如 OU 过程、线性趋势或确定性跟踪)。模型权重基于 BIC 计算,后验概率则是在所有模型之间归一化后的结果。 附表9 显生宙期间氧气与有孔虫大小之间关联分析的假设检验结果,表中列出了在不同模型结构下的 p 值。为校正多重比较,采用了 Bonferroni 校正方法(显著性水平 α = 0.05/8 = 0.00625),所检验的关联类型包括对“观测层”或“隐含层”的相关性连接和因果性连接。 附表10 有孔虫大小演化模型结构简化的似然比检验结果,该模型比较旨在评估温度与氧浓度是否能够完全替代隐含层,或解释第一层中的随机性。结果显示,在两种情况下,简化模型的拟合效果显著较差,说明隐含层与随机成分在模型中是不可或缺的。 附表11 最终模型 do.temp.size.cause1 的参数估计及其解释,该双层模型反映了温度和氧浓度对有孔虫大小的因果影响 附表12 为评估不同属在各阶的采样充分性,我们统计了各阶中每个属的样本数量,并利用古生物统计软件包 PAST 生成稀释曲线 附表13 底栖有孔虫属在大灭绝事件和现代灭绝风险中的物种丰富度和地理分布范围表。有孔虫大小指的是每个属的平均值;物种丰富度指的是各阶每个属的有孔虫种数,其中不包含不定种与未定种;地理分布范围指的是每个属在各阶分布的等面积网格数量。在灭绝与否这一列中“1”表示灭绝,“0”表示残存。表格中的数据都是根据附表27计算得出,F-F, Frasnian-Famennian mass extinction; G-L, Guadalupingian-Lopingian extinction; P-T, Permian-Triassic mass extinction; T-J, Triassic-Jurassic mass extinction; K-Pg, Cretaceous-Paleogene mass extinction. 附表14 灭绝选择性分析所适用的有孔虫原始数据 附件15 本次数据分析所使用的代码集合,本次分析均通过R.4.3.2实现[151]. 附表16 基于1000次自助法重采样迭代,对Frasnian-Famennian(F-F)和Triassic-Jurassic(T-J)大灭绝事件中灭绝属与残存属之间大小差异的Mann-Whitney U检验和Bonferroni校正结果。 附表17 二叠纪-三叠纪各阶有孔虫样本壳体大小 附表18 有孔虫样本在早-中二叠世、晚二叠世、早三叠世和中-晚三叠世的壳体体积分布 附表19 二叠纪-三叠纪属级平均值在各阶的大小分布表(lg μm3) 附表20 二叠纪-三叠纪属级最大值在各阶的大小分布表(lg μm3) 附表21 不同亚目有孔虫在各阶的大小分布 附表22 䗴亚目各属有孔虫在二叠纪-三叠纪的大小变化 附表23 䗴亚目有孔虫在中晚二叠世之交和二叠纪-三叠纪之交的小型化机制 附表24 瓶虫亚目各属有孔虫在二叠纪-三叠纪的大小变化 附表25 瓶虫亚目有孔虫在中晚二叠世之交和二叠纪-三叠纪之交的小型化机制 小粟虫亚目各属有孔虫在二叠纪-三叠纪的大小变化 附表26 小粟虫亚目有孔虫在中晚二叠世之交和二叠纪-三叠纪之交的小型化机制 附表27 串珠虫亚目各属有孔虫在二叠纪-三叠纪的大小变化 文件中包含R分析代码和有孔虫大小数据,其中有孔虫大小单位为lg μm3。