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AmelieSchreiber/binding_sites_random_split_by_family

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Hugging Face2023-09-12 更新2024-03-04 收录
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https://hf-mirror.com/datasets/AmelieSchreiber/binding_sites_random_split_by_family
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资源简介:
这是一个从UniProt获取的数据集的精炼版本。数据集首先按家族排序,然后随机选择家族,直到大约20%的数据被分离出来作为测试数据。接着,每个长度超过1000个残基的序列被分割成不超过1000个氨基酸的非重叠部分。任何只有部分结合位点注释的序列(包含`<`、`>`或`?`的序列)被丢弃。

This is a refined version of a dataset sourced from UniProt. The dataset is first sorted by protein families, then families are randomly selected until approximately 20% of the data is set aside as test data. Subsequently, any sequence longer than 1000 residues is split into non-overlapping segments each containing no more than 1000 amino acids. Any sequence with partial binding site annotations (i.e., sequences containing `<`, `>`, or `?`) is discarded.
提供机构:
AmelieSchreiber
原始信息汇总

数据集概述

数据来源

  • 数据集来源于UniProt。

数据处理步骤

  1. 数据首先按家族分类。
  2. 随机选择部分家族,直到约20%的数据被分离出来作为测试数据。
  3. 将长度超过1000个残基的序列分割成不超过1000个氨基酸的非重叠部分。
  4. 丢弃仅具有部分结合位点注释的序列(包含<>?的序列)。
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