BioLiP2-Opt Dataset

BioLiP2-Opt, a protein-ligand binding dataset that contains 3000+ unique PDB entries with binding affinity annotations, 5600+ protein-ligand complexes structures optimized by PDBBind-Opt workflow.biolip2_opt.tar.gz: Protein-Ligand complexes structures in BioLiP2-Optbiolip2_opt_metadata.csv: Metadata for this dataset, including year, resolution, binding affinity annotationsREADME.md: Description of the structural dataset and columns in the metadata csv file

BioLiP2-Opt 是一款蛋白质-配体结合数据集，包含3000余个唯一PDB（Protein Data Bank）条目且均带有结合亲和力注释，同时涵盖5600余个经PDBBind-Opt流程优化的蛋白质-配体复合物结构。
biolip2_opt.tar.gz：BioLiP2-Opt数据集内的蛋白质-配体复合物结构文件
biolip2_opt_metadata.csv：该数据集的元数据文件，包含年份、分辨率、结合亲和力注释等信息
README.md：本结构数据集及元数据CSV文件各字段的说明文档

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BioLiP2-Opt Dataset是一个蛋白质-配体结合数据集，包含3000多个独特的PDB条目和5600多个经过优化的蛋白质-配体复合物结构，适用于结构生物学和计算化学研究。数据集还提供了详细的元数据，包括结合亲和力注释等关键信息。