3D-GDP

3D-GDP, for interspecies comparative functional genomics. 3D-GDP includes all publicly available plant 3D genome sequences. It offers detailed analyses and comparisons of 3D genome structures among 26 plant species, with comprehensive information on topologically associating domains (TADs), loops, and compartments, as well as gene annotations.

3D-GDP是面向种间比较功能基因组学的数据集。该数据集囊括了所有公开可获取的植物三维基因组序列，针对26个植物物种的三维基因组结构提供了详尽的分析与比较结果，涵盖拓扑关联结构域（TADs）、染色质环、染色质区室的全面信息，同时包含完整的基因注释内容。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

3D-GDP是一个植物3D基因组数据库，提供基因组结构、区室、TAD（拓扑关联域）、环等信息的浏览和分析工具。